Urodzony 19 września 1954 r. w Białymstoku. Absolwent kierunku historia Uniwersytetu Warszawskiego Filii w Białymstoku. Na Wydziale Historycznym Uniwersytetu Warszawskiego w 1988 r. obronił rozprawę doktorską, tam też w 1998 r. uzyskał stopień doktora habilitowanego. Od 1999 r. profesor nadzwyczajny Uniwersytetu w Białymstoku. Od 23 XII 2010 r. profesor zwyczajny.
Współzałożyciel i członek pierwszej Komisji Zakładowej NSZZ, „Solidarność” Uniwersytetu Warszawskiego Filii w Białymstoku. Od 1978 r. pracownik naukowo-dydaktyczny UW Filii w Białymstoku, następnie Uniwersytetu w Białymstoku. Wicedyrektor (1991–1999) i dyrektor (1999–2000) Instytutu Historii Uniwersytetu w Białymstoku; od 2000 r. wiceprzewodniczący Rady Naukowej Instytutu Historii UwB. Od 17 X 2000 r. dyrektor i organizator Oddziału Instytutu Pamięci Narodowej w Białymstoku. Odwołany ze stanowiska dyrektora 21 III 2012 r.
Staże naukowe we Francji (1981, 1992) i we Włoszech (1989). Członek: Biura Wykonawczego Międzynarodowej Komisji Demografii Historycznej CISH Komitetu Nauk Demograficznych PAN i przewodniczący Sekcji Demografii Historycznej KND PAN; Komisji Historii Gospodarczej i Komisji Historii Kobiet Komitetu Nauk Historycznych PAN. Od 2012 r. sekretarz naukowy Komitetu Nauk Historycznych PAN.
Członek polskiej delegacji na Międzynarodowe Kongresy Historii Gospodarczej w Louvain (1990) i Mediolanie (1994) oraz Międzynarodowe Kongresy Nauk Historycznych w Montrealu (1995) i Oslo (2000).
Cezary Kuklo jest autorem ponad 200 publikacji naukowych z zakresu historii społeczno-gospodarczej i demografii historycznej, ogłoszonych w kraju i za granicą, w tym książek: „Rodzina w osiemnastowiecznej Warszawie” (1991); „Informatyczny system rekonstrukcji rodzin, gospodarstw domowych i społeczności lokalnych w Polsce przedrozbiorowej” (1994 z W. Gruszeckim); „Kobieta samotna w społeczeństwie miejskim u schyłku Rzeczypospolitej szlacheckiej” (1998), a także współautorem monumentalnego dwutomowego opracowania „Historia Polski w liczbach” (2003–2006).
Z-ca redaktora naczelnego „Przeszłość Demograficzna Polski”, członek rady programowej „Pamięć i Sprawiedliwość” oraz członek redakcji: „Roczniki Dziejów Społecznych i Gospodarczych”, „Społeczeństwo Staropolskie. Seria Nowa”, „Studia Podlaskie”, „Biuletyn Historii Pogranicza”, „Słownik Biograficzny Białostocko-Łomżyńsko-Suwalski”.
Cezary Kuklo jest członkiem: Francuskiego Tow. Demografii Historycznej, Włoskiego Tow. Demografii Historycznej, Polskiego Tow. Historycznego, Poznańskiego Tow. Przyjaciół Nauk i Białostockiego Tow. Naukowego. Obecnie społecznie pełni funkcję członka Zarządu Oddziału PTH w Białymstoku.
Laureat I nagrody w międzynarodowym konkursie Association Internationale d’Histoire Economique na najlepszą pracę doktorską okresu wczesnonowożytnego (Louvain 1990), nagrody indywidualnej Ministra Edukacji Narodowej za rozprawę habilitacyjną (1999). Odznaczony m.in.: „Srebrną Odznaką „Zasłużony Białostocczyźnie” (1998), Odznaką Honorowego Sybiraka (2004), Medalem z okazji 25. rocznicy podpisania Porozumień Sierpniowych i powstania NSZZ „Solidarność” (2005), Złotym Krzyżem Zasługi (2011).
Żonaty, ma dwie córki.
