• Konferencja naukowa „Warszawa niepokonana (1980–1989). Antysystemowe formy oporu w stolicy” – Warszawa, 8–9 grudnia 2011
• Konferencja naukowa „Jan Józef Lipski z perspektywy XXI wieku” – Warszawa, 19 września 2011
• Konferencja naukowa „Amnestie – drogi do zagłady czy »legalizacji«?” – Warszawa, 26 listopada 2010
• Konferencja naukowa „Mechanizmy i ludzie władzy w PRL” – Warszawa, 14–15 października 2010
• Konferencja naukowa „Inwigilować, neutralizować, rozbijać. Stefan Korboński i emigracja polityczna jako obiekt zainteresowania wywiadu PRL w latach 1945–1989” – Warszawa, 24–25 marca 2010
• Konferencja „Rzeczpospolita utracona. Polityczne, społeczne i kulturalne skutki faszyzmu i komunizmu na ziemiach polskich” – Warszawa, 11 grudnia 2009
   
• Międzynarodowa konferencja naukowa „Ofiary imperiów – Imperia jako ofiary” – Warszawa, 19–21 lutego 2009
• Konferencja naukowa „PPS. Dlaczego się nie udało?” – Warszawa, 21 listopada 2008 r.
• Konferencja naukowa „Powiat Ostrołęka w pierwszej dekadzie rządów komunistycznych” – Ostrołęka, 23 października 2008 r.
• Konferencja naukowa „W objęciach »Wielkiego Brata«. Sowieci w Polsce 1939–1993” – Warszawa, 30 listopada 2007 r.
• Konferencja naukowa „Powiat pułtuski w pierwszej dekadzie rządów komunistycznych” – Pułtusk, 16 października 2007 r.
• Konferencja dla nauczycieli „Dwa powstania – Powstanie w Getcie Warszawskim 1943 i Powstanie Warszawskie 1944” – Warszawa, 21 marca 2007 r.
   
• Konferencja naukowa „»Jesteście naszą wielką szansą«. Młodzież na rozstajach komunizmu 1944-1989” – Warszawa, 17 listopada 2006
• Konferencja naukowa "Z Archiwum X Departamentu"  – Warszawa, 17 listopada 2005 r.
• Konferencja dla nauczycieli „Polscy Wallenbergowie – pomoc Żydom w okupowanej Polsce 1939–1945” – Warszawa, 21 października 2004 r.
• Konferencja naukowa "»Zwyczajny« resort. Ludzie i metody »Bezpieki« 1944–1956" – Warszawa, 8 października 2003 r.
• Konferencja naukowa i wystawa "Marzec 1968"  - Warszawa, 6–7 marca 2003 r.
• Konferencja naukowa "Ostatni "leśni" - Mazowsze i Podlasie w ogniu 1947-1954." Sesja poświęcona zbrojnemu Podziemiu Niepodległościowemu - Warszawa, 5 czerwca 2002 r.
• Konferencja naukowa "Co nam zostało z tamtych lat...". Dyskusyjne spotkanie działaczy opozycji demokratycznej z lat 1976-1980 - Warszawa, 10-11 czerwca 2002 r.
• Konferencja naukowa "1956: Budapeszt - Warszawa jedna sprawa" - Warszawa, 19 października 2001 r.
• Konferencja naukowa "Czerwiec 1976 po 25 latach - spory i refleksje" - Radom, 19 czerwca 2001 r.